כחמש דקות לפני כניסת השבת קיבלה רכבת ישראל הנחיה על הפסקת העבודות בשבת זו. זאת, בעת שהצוותים הטכניים היו בעבודה ואף פירקו חלק מהמסילות צפונית לת"א לצורך תחזוקה. הצוותים עזבו את נקודות העבודה מבלי יכולת להשיב את מצבן לקדמותו, אלא עם צאת השבת. לכן, תנועת הרכבות בין חיפה לת"א בשני הכיוונים לא תוכל להתחדש עד יום א' בערב.

בהערכת מצב שהתקיימה בהנהלת רכבת ישראל, בראשות המנכ"ל בעז צפריר, בדבר אופן הפעלת הרכבות במוצ"ש ויום א סוכם כי קו ת"א חיפה יהיה סגור במוצ"ש וגם ביום ראשון עד הערב. זאת, לצורך השלמת העבודות שהחלו ביום שישי. הרכבות הצפוניות יסעו כרכבות פארבריות בין נהריה לבנימינה בלבד. רכבת ישראל תעשה כל מאמץ יחד עם משרד הביטחון להעמיד אוטובוסים למען החיילים ביום א' בבקר. תנועת הרכבות תשוב ללו"ז הרגיל ביום ראשון בערב..

כדי לפתור את משבר הסעת החיילים חל מהערב מפעילים צה"ל ואגף אמו"ן במשרד הביטחון מערך הסעות חלופי לחיילים, בעקבות עבודות התשתית ברכבת ישראל. המערך יכלול עשרות אוטובוסים בין צפון הארץ למרכזה, בשני הכיוונים. החלטה זו התקבלה על מנת לתת מענה לחיילי צה"ל, בנוסף לתחבורה הציבורית שבה זכאים החיילים לנסוע ללא עלות.

הערב, מוצ"ש, יפעל מערך הסעות חלופי מתחנת הרכבת חיפה-חוף הכרמל לתחנת הרכבת תל אביב-סבידור מרכז, לשני הכיוונים. האוטובוסים יעברו בתחנות הרכבת בנימינה, חדרה-מערב, נתניה מרכז, בית יהושע והרצלייה.

מחר ביום ראשון, א' באלול התשע"ו, 4 בספטמבר 2016, בין השעות 06:30-12:00 יתוגבר מערך ההיסעים הקבוע שמספק צה"ל לחייליו מדי יום ראשון כתוספת למערך הרכבות, בתחנות חיפה-חוף הכרמל, בנימינה, חדרה-מערב, נתניה, בית יהושע, הרצלייה ותל אביב-סבידור מרכז. שאר הרכבות מדרום הארץ לתל אביב, לשני הכיוונים, יעבדו כסדרן. בנוסף, יתוגברו הקווים הקיימים הנוסעים דרומה ישירות לבאר שבע ולקריית ההדרכה.

גם חברת אגד בתיאום הגורמים הבכירים והמקצועיים במשרד התחבורה תתגבר באופן ניכר החל מהערב את קווי השרות בין ת״א לחיפה בשני הכיוונים, באמצעות גיוס אוטובוסים מחברת הבת ״אגד היסעים״ וחברות אוטובוסים פרטיות לצורך מתן מענה של ממש לעשרות אלפי המשתמשים בתוואי הנסיעה הזה מקרב החיילים והאזרחים כאחד… אגד נערך בשלב הראשון להוספה של כ- 50 אוטובוסים בקווים אלה החל ממוצאי שבת ובמרוצת יום ראשון הקרוב. גורמי התנועה באגד מעריכים שיוכלו להתגבר על הביקושים הערים לשרות בתוואי חשוב זה כפי שאנו עושים תמיד בעת שנוצרת בעיה תחבורתית של ממש במדינת ישראל״.